La principale mission du CNSF est de contribuer à la lutte contre la désertification et à la reconstitution du couvert végétal dans un contexte de changement climatique.
Pour atteindre cette mission, quatre objectifs spécifiques ont été définis. Il s’agit de :
1. appuyer les programmes de reconstitution du couvert végétal par la production de semences de bonne qualité et en assurer la diffusion ;
2. contribuer en rapport avec le Centre National de la Recherche Scientifique et Technologique (CNRST) à la recherche scientifique sur les espèces forestières locales, à leur promotion, à leur vulgarisation et à la maîtrise des conditions de conservation et de germination des semences, et leur sylviculture ;
3. contribuer à la conservation de la diversité biologique par le développement de conservatoires (in et ex-situ) ;
4. contribuer à l’auto promotion paysanne par un transfert soutenu des connaissances techniques au monde rural.